Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms