Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIPC1O14908 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC1O14908 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms