Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms