Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQ87 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQ87 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQ87 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQ87 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQ87 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQ87 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQ87 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQ87 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQ87 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQ87 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQ87 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQ87 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQ87 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQ87 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQ87 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQ87 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQ87 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQ87 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQ87 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQ87 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQ87 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQ87 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQ87 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQ87 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQ87 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQ87 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U3KQ87 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U3KQ87 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U3KQ87 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
U3KQ87 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U3KQ87 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U3KQ87 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
U3KQ87 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U3KQ87 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
U3KQ87 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U3KQ87 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQ87 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQ87 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQ87 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQ87 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQ87 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQ87 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQ87 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQ87 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQ87 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQ87 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQ87 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQ87 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQ87 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQ87 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQ87 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQ87 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQ87 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQ87 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQ87 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQ87 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQ87 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQ87 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U3KQ87 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U3KQ87 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U3KQ87 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U3KQ87 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U3KQ87 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U3KQ87 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQ87 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQ87 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQ87 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQ87 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQ87 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQ87 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQ87 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQ87 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQ87 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQ87 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQ87 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQ87 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQ87 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQ87 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQ87 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQ87 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQ87 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U3KQ87 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U3KQ87 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U3KQ87 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms