Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB11Q9Y547 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB11Q9Y547 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HSPB11Q9Y547 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms