Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB2Q9UPW6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SATB2Q9UPW6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SATB2Q9UPW6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms