Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFSF18Q9UNG2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNFSF18Q9UNG2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms