Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN2Q9UL51 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN2Q9UL51 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.7 ms