Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCOLCE2Q9UKZ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCOLCE2Q9UKZ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms