Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF11Q9UIL8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF11Q9UIL8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF11Q9UIL8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms