Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNNA3Q9UI47 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTNNA3Q9UI47 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms