Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC6Q9UBN7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC6Q9UBN7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC6Q9UBN7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC6Q9UBN7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms