Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XCL2Q9UBD3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCL2Q9UBD3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
XCL2Q9UBD3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
XCL2Q9UBD3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 368 ms