Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.221e-8■□□□□ 9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 227.89■■■□□ 2.061e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.791e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.411e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 320.08■□□□□ 0.811e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 518.37■□□□□ 0.531e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 215.42■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 314.76□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-8■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 516.11■□□□□ 0.171e-24■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.371e-24■□□□□ 8.9
STAU2Q9NUL3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.359e-7■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.249e-7■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 315□□□□□ -0.019e-7■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.067e-13■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.077e-13■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 DOT1L-205ENST00000478937 638 ntTSL 313.53□□□□□ -0.249e-7■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.287e-13■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)19.91■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 219.8■□□□□ 0.763e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.683e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.63e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.413e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.273e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.233e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.143e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 412.58□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 212.3□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.483e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.543e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AL132780.3-201ENST00000555074 835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.713e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-205ENST00000548573 2095 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-206ENST00000549274 611 ntTSL 310.1□□□□□ -0.793e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 49.95□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SMARCD1-207ENST00000549526 401 ntTSL 58.05□□□□□ -1.123e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 36.21□□□□□ -1.423e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.513e-6■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 318.93■□□□□ 0.623e-9■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.153e-9■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-9■□□□□ 8.8
STAU2Q9NUL3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.994e-8■□□□□ 8.7
STAU2Q9NUL3 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.65□□□□□ -1.664e-61■□□□□ 8.7
STAU2Q9NUL3 SMG1P3-202ENST00000437413 589 ntTSL 422.51■■□□□ 1.194e-6■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SMG1P3-201ENST00000435197 416 ntTSL 318.16■□□□□ 0.54e-6■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.324e-6■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.065e-11■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.741e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.971e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.821e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-207ENST00000596995 2106 ntTSL 219.96■□□□□ 0.791e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-204ENST00000414294 2211 ntTSL 219.81■□□□□ 0.761e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 APOBEC3C-202ENST00000428892 1056 ntTSL 310.97□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 8.6
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-202ENST00000425816 1950 ntTSL 1 (best)16.24■□□□□ 0.191e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-204ENST00000441260 1046 ntTSL 216.23■□□□□ 0.191e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-206ENST00000493837 3769 ntTSL 210.74□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 ST6GAL1-220ENST00000470633 4893 ntTSL 27.43□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 320.85■□□□□ 0.939e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 216.61■□□□□ 0.259e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)16.44■□□□□ 0.229e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-212ENST00000530451 656 ntTSL 519.3■□□□□ 0.682e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.462e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 CTSB-203ENST00000420692 2230 ntTSL 216.92■□□□□ 0.32e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-204ENST00000449943 4547 ntTSL 211.82□□□□□ -0.522e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 SYVN1-206ENST00000526060 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.532e-8■□□□□ 8.5
STAU2Q9NUL3 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 36.48□□□□□ -1.372e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 425.43■■□□□ 1.668e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.718e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 516.27■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.128e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.098e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.168e-6■□□□□ 8.4
STAU2Q9NUL3 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 313.61□□□□□ -0.238e-6■□□□□ 8.4
Retrieved 100 of 1,542 protein–RNA pairs in 72.9 ms