RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCC9O60706 1549 aa24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3C-202ENST00000428892 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3C-202ENST00000428892 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 NACADO15069 1562 aa23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3C-202ENST00000428892 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.68■■□□□ 1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3C-202ENST00000428892 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCRIBQ14160 1630 aa22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3C-202ENST00000428892 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3C-202ENST00000428892 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERCC6Q03468 1493 aa21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 CUX2O14529 1486 aa21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCAPD3P42695 1498 aa21.29■■□□□ 1
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMARCA2P51531 1590 aa21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMARCA4P51532 1647 aa21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3C-202ENST00000428892 HMGXB3Q12766 1538 aa21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3C-202ENST00000428892 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 NESP48681 1621 aa21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3C-202ENST00000428892 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3C-202ENST00000428892 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3C-202ENST00000428892 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.66■□□□□ 0.9
APOBEC3C-202ENST00000428892 WIZO95785 1651 aa20.65■□□□□ 0.9
APOBEC3C-202ENST00000428892 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.65■□□□□ 0.9
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR62O43379 1518 aa20.62■□□□□ 0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIM41Q8WV44 630 aa20.6■□□□□ 0.89
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.56■□□□□ 0.88
APOBEC3C-202ENST00000428892 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRDM2Q13029 1718 aa20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 CFTRP13569 1480 aa20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 OSCARQ8IYS5 282 aa20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3C-202ENST00000428892 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3C-202ENST00000428892 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3C-202ENST00000428892 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3C-202ENST00000428892 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFT140Q96RY7 1462 aa20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.05■□□□□ 0.8
APOBEC3C-202ENST00000428892 TOPBP1Q92547 1522 aa20.05■□□□□ 0.8
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARHGEF11O15085 1522 aa20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCC8Q09428 1581 aa20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHD1O14646 1710 aa20.02■□□□□ 0.79
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20■□□□□ 0.79
APOBEC3C-202ENST00000428892 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
APOBEC3C-202ENST00000428892 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBLN2P98095 1184 aa19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARAP1Q96P48 1450 aa19.78■□□□□ 0.76
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR97A6NE52 1622 aa19.74■□□□□ 0.75
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.73■□□□□ 0.75
APOBEC3C-202ENST00000428892 SOGA1O94964 1423 aa19.72■□□□□ 0.75
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.71■□□□□ 0.75
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYNJ1O43426 1573 aa19.7■□□□□ 0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.69■□□□□ 0.74
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APOBEC3C-202ENST00000428892 PBRM1Q86U86 1689 aa19.65■□□□□ 0.74
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
APOBEC3C-202ENST00000428892 CUX1P39880 1505 aa19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRIN2BQ13224 1484 aa19.6■□□□□ 0.73
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYNJ2O15056 1496 aa19.57■□□□□ 0.72
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.49■□□□□ 0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.47■□□□□ 0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.41■□□□□ 0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADAMTS12P58397 1594 aa19.36■□□□□ 0.69
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRIN2AQ12879 1464 aa19.35■□□□□ 0.69
APOBEC3C-202ENST00000428892 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEP170Q5SW79 1584 aa19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3C-202ENST00000428892 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3C-202ENST00000428892 TOP2BQ02880 1626 aa19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3C-202ENST00000428892 SHROOM2Q13796 1616 aa19.26■□□□□ 0.67
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUP160Q12769 1436 aa19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3C-202ENST00000428892 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.23■□□□□ 0.67
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