Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPHNQ9NQX3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GPHNQ9NQX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
GPHNQ9NQX3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPHNQ9NQX3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms