Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM8Q9NQV8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms