Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM5Q9C035 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM5Q9C035 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM5Q9C035 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM5Q9C035 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms