Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VN1R3Q9BXE9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VN1R3Q9BXE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VN1R3Q9BXE9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms