Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USB1Q9BQ65 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USB1Q9BQ65 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USB1Q9BQ65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms