Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms