Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CELF1Q92879 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CELF1Q92879 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CELF1Q92879 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms