Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXQ3

LINC01599, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01599, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01599Q8WXQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINC01599Q8WXQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC01599Q8WXQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC01599Q8WXQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC01599Q8WXQ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms