Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF555Q8NEP9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF555Q8NEP9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms