Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC190Q86UF4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC190Q86UF4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms