Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFXL1Q6ZNB6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFXL1Q6ZNB6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFXL1Q6ZNB6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NFXL1Q6ZNB6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms