Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH2D4BQ5SQS7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH2D4BQ5SQS7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH2D4BQ5SQS7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms