Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT12Q53H54 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT12Q53H54 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT12Q53H54 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms