Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL40Q2TBA0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KLHL40Q2TBA0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHL40Q2TBA0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms