Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GEN1Q17RS7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GEN1Q17RS7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GEN1Q17RS7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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