Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-8■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.091e-8■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 FGL1-204ENST00000398056 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-7■□□□□ 9.4
SAFBQ15424 RNF19A-211ENST00000523167 792 ntTSL 428.88■■■□□ 2.213e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.83e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.765e-9■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TMEM37-204ENST00000465296 820 ntTSL 318.06■□□□□ 0.485e-9■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.475e-9■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TMEM37-203ENST00000417645 522 ntTSL 316.94■□□□□ 0.35e-9■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-203ENST00000517584 317 ntTSL 1 (best)12.16□□□□□ -0.463e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-210ENST00000522369 612 ntTSL 49.45□□□□□ -0.93e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-213ENST00000523481 547 ntTSL 48.73□□□□□ -1.013e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-202ENST00000432381 432 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.093e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.353e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 RNF19A-206ENST00000519527 817 ntTSL 36.16□□□□□ -1.423e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.722e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 CCDC26-202ENST00000520048 904 ntTSL 39.64□□□□□ -0.876e-6■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.916e-6■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.266e-6■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TPR-205ENST00000474852 2757 ntTSL 1 (best)18.64■□□□□ 0.572e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 219.35■□□□□ 0.691e-13■□□□□ 9.3
SAFBQ15424 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 214.67□□□□□ -0.069e-10■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.469e-10■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.499e-10■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.386e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.976e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.636e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.66e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.316e-6■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.43e-7■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 ZC3H11A-212ENST00000495527 8404 ntTSL 1 (best)6.04□□□□□ -1.443e-7■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.583e-7■□□□□ 9.2
SAFBQ15424 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 210.47□□□□□ -0.737e-7■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.114e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 513.67□□□□□ -0.224e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-209ENST00000602812 2356 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.464e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.554e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 36.38□□□□□ -1.394e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.464e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 FTX-218ENST00000641360 3897 nt5.85□□□□□ -1.474e-9■□□□□ 9.1
SAFBQ15424 RIF1-207ENST00000454583 3552 ntTSL 25.5□□□□□ -1.536e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 NKTR-211ENST00000468735 7964 ntTSL 28.84□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 22.69□□□□□ -1.981e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 525.77■■□□□ 1.727e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.347e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.867e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 07e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.227e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.337e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.67e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 36.76□□□□□ -1.337e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-205ENST00000478200 637 ntTSL 423.83■■□□□ 1.411e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-212ENST00000497664 590 ntTSL 423.83■■□□□ 1.411e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-209ENST00000491513 744 ntTSL 421.45■■□□□ 1.021e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-211ENST00000497630 933 ntTSL 221.29■■□□□ 11e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-204ENST00000477954 1034 ntTSL 317.69■□□□□ 0.421e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.371e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 UBE2G2-206ENST00000481546 4340 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.841e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.16□□□□□ -1.427e-8■□□□□ 9
SAFBQ15424 AKAP9-204ENST00000394534 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.25□□□□□ -1.416e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.436e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.886e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.936e-7■□□□□ 9
SAFBQ15424 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.217e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.856e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 SMCHD1-206ENST00000581631 729 ntTSL 33.85□□□□□ -1.796e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 SMCHD1-203ENST00000577880 4951 ntTSL 23.57□□□□□ -1.846e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 SMCHD1-211ENST00000584897 4143 ntTSL 22.25□□□□□ -2.056e-7■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.171e-6■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 56.03□□□□□ -1.441e-6■□□□□ 8.9
SAFBQ15424 LUC7L3-209ENST00000506686 582 ntTSL 413.91□□□□□ -0.184e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.197e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.891e-8■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)21.6■■□□□ 1.057e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.997e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 319■□□□□ 0.631e-8■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.157e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.137e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-211ENST00000487652 565 ntTSL 415.55■□□□□ 0.087e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-210ENST00000481024 2401 ntTSL 215.08■□□□□ 0.017e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-207ENST00000427190 4573 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.067e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-208ENST00000471362 420 ntTSL 313.45□□□□□ -0.267e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 GK-209ENST00000479048 582 ntTSL 49.83□□□□□ -0.847e-7■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.841e-8■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 322.06■■□□□ 1.121e-8■□□□□ 8.8
SAFBQ15424 RNASET2-212ENST00000510083 2280 ntTSL 218.21■□□□□ 0.519e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 511.6□□□□□ -0.559e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.079e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)25.59■■□□□ 1.699e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-204ENST00000399237 822 ntTSL 523.95■■□□□ 1.429e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.989e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.739e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.739e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.559e-7■□□□□ 8.7
SAFBQ15424 FUS-211ENST00000568901 521 ntTSL 211.34□□□□□ -0.599e-7■□□□□ 8.7
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