RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638985.1

FTX-216, Transcript of FTX transcript, XIST regulator, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FTX, Length 1,367 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTX-216ENST00000638985 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.86■■■■□ 3.01
FTX-216ENST00000638985 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.98■■■□□ 2.39
FTX-216ENST00000638985 ABCC9O60706 1549 aa29.57■■■□□ 2.32
FTX-216ENST00000638985 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.45■■■□□ 2.14
FTX-216ENST00000638985 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.34■■■□□ 2.13
FTX-216ENST00000638985 NACADO15069 1562 aa28.3■■■□□ 2.12
FTX-216ENST00000638985 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
FTX-216ENST00000638985 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.12■■■□□ 2.09
FTX-216ENST00000638985 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.98■■■□□ 2.07
FTX-216ENST00000638985 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.71■■■□□ 2.03
FTX-216ENST00000638985 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.52■■■□□ 2
FTX-216ENST00000638985 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.49■■□□□ 1.99
FTX-216ENST00000638985 SCRIBQ14160 1630 aa27.44■■□□□ 1.98
FTX-216ENST00000638985 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.28■■□□□ 1.96
FTX-216ENST00000638985 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.19■■□□□ 1.94
FTX-216ENST00000638985 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FTX-216ENST00000638985 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.66■■□□□ 1.86
FTX-216ENST00000638985 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.57■■□□□ 1.84
FTX-216ENST00000638985 SMARCA4P51532 1647 aa26.22■■□□□ 1.79
FTX-216ENST00000638985 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
FTX-216ENST00000638985 NCAPD3P42695 1498 aa26.18■■□□□ 1.78
FTX-216ENST00000638985 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.18■■□□□ 1.78
FTX-216ENST00000638985 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.1■■□□□ 1.77
FTX-216ENST00000638985 SMARCA2P51531 1590 aa26.09■■□□□ 1.77
FTX-216ENST00000638985 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.97■■□□□ 1.75
FTX-216ENST00000638985 HMGXB3Q12766 1538 aa25.97■■□□□ 1.75
FTX-216ENST00000638985 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
FTX-216ENST00000638985 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
FTX-216ENST00000638985 WIZO95785 1651 aa25.74■■□□□ 1.71
FTX-216ENST00000638985 NESP48681 1621 aa25.56■■□□□ 1.68
FTX-216ENST00000638985 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
FTX-216ENST00000638985 ERCC6Q03468 1493 aa25.48■■□□□ 1.67
FTX-216ENST00000638985 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.44■■□□□ 1.66
FTX-216ENST00000638985 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.41■■□□□ 1.66
FTX-216ENST00000638985 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.34■■□□□ 1.65
FTX-216ENST00000638985 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.26■■□□□ 1.63
FTX-216ENST00000638985 CFTRP13569 1480 aa25.25■■□□□ 1.63
FTX-216ENST00000638985 CUX2O14529 1486 aa25.21■■□□□ 1.63
FTX-216ENST00000638985 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
FTX-216ENST00000638985 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.11■■□□□ 1.61
FTX-216ENST00000638985 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.11■■□□□ 1.61
FTX-216ENST00000638985 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
FTX-216ENST00000638985 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.06■■□□□ 1.6
FTX-216ENST00000638985 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.05■■□□□ 1.6
FTX-216ENST00000638985 WDR62O43379 1518 aa24.92■■□□□ 1.58
FTX-216ENST00000638985 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FTX-216ENST00000638985 PRDM2Q13029 1718 aa24.79■■□□□ 1.56
FTX-216ENST00000638985 TOPBP1Q92547 1522 aa24.68■■□□□ 1.54
FTX-216ENST00000638985 ABCC8Q09428 1581 aa24.67■■□□□ 1.54
FTX-216ENST00000638985 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.61■■□□□ 1.53
FTX-216ENST00000638985 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.6■■□□□ 1.53
FTX-216ENST00000638985 IFT140Q96RY7 1462 aa24.56■■□□□ 1.52
FTX-216ENST00000638985 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
FTX-216ENST00000638985 CUX1P39880 1505 aa24.48■■□□□ 1.51
FTX-216ENST00000638985 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
FTX-216ENST00000638985 SOGA1O94964 1423 aa24.43■■□□□ 1.5
FTX-216ENST00000638985 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.41■■□□□ 1.5
FTX-216ENST00000638985 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.41■■□□□ 1.5
FTX-216ENST00000638985 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FTX-216ENST00000638985 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
FTX-216ENST00000638985 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
FTX-216ENST00000638985 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
FTX-216ENST00000638985 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FTX-216ENST00000638985 OSCARQ8IYS5 282 aa24.25■■□□□ 1.47
FTX-216ENST00000638985 SYNJ1O43426 1573 aa24.21■■□□□ 1.47
FTX-216ENST00000638985 TOP2BQ02880 1626 aa24.21■■□□□ 1.47
FTX-216ENST00000638985 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.16■■□□□ 1.46
FTX-216ENST00000638985 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.15■■□□□ 1.46
FTX-216ENST00000638985 WDR97A6NE52 1622 aa24.14■■□□□ 1.45
FTX-216ENST00000638985 FBLN2P98095 1184 aa24.13■■□□□ 1.45
FTX-216ENST00000638985 GRIN2BQ13224 1484 aa24.12■■□□□ 1.45
FTX-216ENST00000638985 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.11■■□□□ 1.45
FTX-216ENST00000638985 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.08■■□□□ 1.45
FTX-216ENST00000638985 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FTX-216ENST00000638985 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FTX-216ENST00000638985 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24■■□□□ 1.43
FTX-216ENST00000638985 SYNJ2O15056 1496 aa23.96■■□□□ 1.43
FTX-216ENST00000638985 CHD1O14646 1710 aa23.91■■□□□ 1.42
FTX-216ENST00000638985 PBRM1Q86U86 1689 aa23.89■■□□□ 1.42
FTX-216ENST00000638985 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.85■■□□□ 1.41
FTX-216ENST00000638985 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.84■■□□□ 1.41
FTX-216ENST00000638985 KIF27Q86VH2 1401 aa23.84■■□□□ 1.41
FTX-216ENST00000638985 ADAMTS12P58397 1594 aa23.8■■□□□ 1.4
FTX-216ENST00000638985 TRIM41Q8WV44 630 aa23.79■■□□□ 1.4
FTX-216ENST00000638985 IGF1RP08069 1367 aa23.79■■□□□ 1.4
FTX-216ENST00000638985 GRIN2AQ12879 1464 aa23.79■■□□□ 1.4
FTX-216ENST00000638985 ARHGEF11O15085 1522 aa23.76■■□□□ 1.39
FTX-216ENST00000638985 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.75■■□□□ 1.39
FTX-216ENST00000638985 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.72■■□□□ 1.39
FTX-216ENST00000638985 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.72■■□□□ 1.39
FTX-216ENST00000638985 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.72■■□□□ 1.39
FTX-216ENST00000638985 NUP160Q12769 1436 aa23.7■■□□□ 1.38
FTX-216ENST00000638985 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.65■■□□□ 1.38
FTX-216ENST00000638985 CEP170Q5SW79 1584 aa23.64■■□□□ 1.37
FTX-216ENST00000638985 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.63■■□□□ 1.37
FTX-216ENST00000638985 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.61■■□□□ 1.37
FTX-216ENST00000638985 ARAP1Q96P48 1450 aa23.58■■□□□ 1.37
FTX-216ENST00000638985 CUL7Q14999 1698 aa23.55■■□□□ 1.36
FTX-216ENST00000638985 JPH4Q96JJ6 628 aa23.52■■□□□ 1.36
FTX-216ENST00000638985 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms