Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NFIAQ12857 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFIAQ12857 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFIAQ12857 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFIAQ12857 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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