Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 YCK1YHR135C 1617 nt5.57□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 PET112YBL080C 1626 nt5.57□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 MRS1YIR021W 1092 nt5.57□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 RPS28AYOR167C 204 nt5.57□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 MCP1YOR228C 909 nt5.57□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 LGE1YPL055C 999 nt5.57□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 MRC1YCL061C 3291 nt5.56□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 PRY3YJL078C 2646 nt5.56□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 ATG22YCL038C 1587 nt5.56□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 YGL235WYGL235W 537 nt5.56□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 PPT1YGR123C 1542 nt5.56□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 MPH3YJR160C 1809 nt5.55□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 MNN5YJL186W 1761 nt5.55□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 VPS4YPR173C 1314 nt5.55□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 BUG1YDL099W 1026 nt5.55□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 HOC1YJR075W 1191 nt5.55□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 MCH1YDL054C 1461 nt5.55□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 KEL1YHR158C 3495 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 EXG1YLR300W 1347 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 RPL7AYGL076C 735 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 LIA1YJR070C 978 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 YKR045CYKR045C 552 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 DPH5YLR172C 903 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 PRE5YMR314W 705 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 YOL163WYOL163W 510 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 RPL7BYPL198W 735 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 PTC3YBL056W 1407 nt5.54□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 GUD1YDL238C 1470 nt5.53□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 CLB2YPR119W 1476 nt5.53□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 LCL3YGL085W 825 nt5.53□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 YDR387CYDR387C 1668 nt5.53□□□□□ -1.52
TIR4Q12218 MTC5YDR128W 3447 nt5.52□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 snR82snR82 268 nt5.52□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 FPR3YML074C 1236 nt5.52□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 YOR300WYOR300W 309 nt5.52□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 YPL041CYPL041C 624 nt5.52□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 SPE3YPR069C 882 nt5.52□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 SGF29YCL010C 780 nt5.52□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 HAS1YMR290C 1518 nt5.52□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 TEP1YNL128W 1305 nt5.51□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 PAT1YCR077C 2391 nt5.51□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 YHC3YJL059W 1227 nt5.51□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 RPE1YJL121C 717 nt5.51□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 MHT1YLL062C 975 nt5.51□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 TSR2YLR435W 618 nt5.51□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 RPS3YNL178W 723 nt5.51□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 MRPS12YNR036C 462 nt5.51□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 YOR268CYOR268C 399 nt5.51□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 HIR1YBL008W 2523 nt5.5□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 RPN11YFR004W 921 nt5.5□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 VMA4YOR332W 702 nt5.5□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 ILV1YER086W 1731 nt5.5□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 IVY1YDR229W 1362 nt5.5□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 RPT3YDR394W 1287 nt5.49□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 TAF9YMR236W 474 nt5.49□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 KEX2YNL238W 2445 nt5.49□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 GFA1YKL104C 2154 nt5.49□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 CLB1YGR108W 1416 nt5.48□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 GPA1YHR005C 1419 nt5.48□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 RBS1YDL189W 1374 nt5.48□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 OM45YIL136W 1182 nt5.48□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 RIX7YLL034C 2514 nt5.48□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 SAL1YNL083W 1485 nt5.47□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 WHI2YOR043W 1461 nt5.47□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 ERG8YMR220W 1356 nt5.47□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 GLC8YMR311C 690 nt5.47□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 AAD14YNL331C 1131 nt5.47□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 GLN1YPR035W 1113 nt5.47□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 KKQ8YKL168C 2175 nt5.47□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 PTK2YJR059W 2457 nt5.47□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 POP1YNL221C 2628 nt5.46□□□□□ -1.53
TIR4Q12218 GCG1YER163C 699 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 MRPS18YNL306W 654 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 IFA38YBR159W 1044 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 FRS2YFL022C 1512 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 AMA1YGR225W 1782 nt5.46□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 RGT2YDL138W 2292 nt5.45□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 SLX5YDL013W 1860 nt5.45□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 VHT1YGR065C 1782 nt5.44□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 PLB3YOL011W 2061 nt5.44□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 ZWF1YNL241C 1518 nt5.44□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 GPD1YDL022W 1176 nt5.44□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 RAD59YDL059C 717 nt5.44□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 PYC1YGL062W 3537 nt5.44□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 YJR084WYJR084W 1272 nt5.44□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 PUS4YNL292W 1212 nt5.44□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.44□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 SDH4YDR178W 546 nt5.43□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 SHO1YER118C 1104 nt5.43□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 YGR127WYGR127W 939 nt5.43□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.43□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.43□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.43□□□□□ -1.54
TIR4Q12218 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.43□□□□□ -1.54
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