Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSRP1Q08945 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSRP1Q08945 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSRP1Q08945 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSRP1Q08945 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSRP1Q08945 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSRP1Q08945 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSRP1Q08945 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSRP1Q08945 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSRP1Q08945 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms