Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YDL241WYDL241W 372 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 ATP12YJL180C 978 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 PCD1YLR151C 1023 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 ATG23YLR431C 1362 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 YPL247CYPL247C 1572 nt7.16□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 ASN2YGR124W 1719 nt7.15□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 TAH11YJR046W 1815 nt7.15□□□□□ -1.26 RIP-Chip
PUF3Q07807 YIP4YGL198W 708 nt7.15□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 RPL31BYLR406C 342 nt7.15□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 SML1YML058W 315 nt7.15□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 ECM2YBR065C 1095 nt7.15□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 POP4YBR257W 840 nt7.15□□□□□ -1.26
PUF3Q07807 PAC2YER007W 1557 nt7.15□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YEN1YER041W 2280 nt7.15□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YOS9YDR057W 1629 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 SHE9YDR393W 1371 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 NTG1YAL015C 1200 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YJL163CYJL163C 1668 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 NMD5YJR132W 3147 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YLL056CYLL056C 897 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YMR034CYMR034C 1305 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 FCP1YMR277W 2199 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YIP3YNL044W 531 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 MRPL19YNL185C 477 nt7.14□□□□□ -1.27 RIP-Chip
PUF3Q07807 ZIM17YNL310C 525 nt7.14□□□□□ -1.27 RIP-Chip
PUF3Q07807 ERG10YPL028W 1197 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YPR076WYPR076W 375 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 PPS1YBR276C 2424 nt7.14□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 MSP1YGR028W 1089 nt7.13□□□□□ -1.27 RIP-Chip
PUF3Q07807 CDA2YLR308W 939 nt7.13□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 SMX3YPR182W 261 nt7.13□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YBR089WYBR089W 600 nt7.13□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 KIN1YDR122W 3195 nt7.13□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 PRP2YNR011C 2631 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YDL121CYDL121C 450 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YDL177CYDL177C 513 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 RTN1YDR233C 888 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 MRPS28YDR337W 861 nt7.12□□□□□ -1.27 RIP-Chip
PUF3Q07807 RPL2BYIL018W 765 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 CBR1YIL043C 855 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YLR118CYLR118C 684 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 FIT2YOR382W 462 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 LGE1YPL055C 999 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YPL068CYPL068C 882 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 ADE17YMR120C 1779 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YLL058WYLL058W 1728 nt7.12□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 ARO9YHR137W 1542 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 CDC10YCR002C 969 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 PRI1YIR008C 1230 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 VTA1YLR181C 993 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 MTG1YMR097C 1104 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 CSL4YNL232W 879 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 MCP1YOR228C 909 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YOR300WYOR300W 309 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 WHI4YDL224C 1950 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 ICP55YER078C 1536 nt7.11□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 HER2YMR293C 1395 nt7.1□□□□□ -1.27 RIP-Chip
PUF3Q07807 GPI18YBR004C 1302 nt7.1□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 CCT3YJL014W 1605 nt7.1□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 TRS31YDR472W 852 nt7.1□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.1□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YOL046CYOL046C 675 nt7.1□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 RGD2YFL047W 2145 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 SEC23YPR181C 2307 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 YNL226WYNL226W 411 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 COS10YNR075W 1125 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 NCE102YPR149W 522 nt7.09□□□□□ -1.27
PUF3Q07807 MUM3YOR298W 1440 nt7.09□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF3Q07807 EFM1YHL039W 1758 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 MRPL32YCR003W 552 nt7.08□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF3Q07807 YDR029WYDR029W 315 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 YDR541CYDR541C 1035 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 BIM1YER016W 1035 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 AGX1YFL030W 1158 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 POP5YAL033W 522 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 AVO2YMR068W 1281 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 SPE3YPR069C 882 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 HSM3YBR272C 1443 nt7.08□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 CMK1YFR014C 1341 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 GSH1YJL101C 2037 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 TRP1YDR007W 675 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 COG7YGL005C 840 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 REV7YIL139C 738 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 URA1YKL216W 945 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 ATG19YOL082W 1248 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 IZH4YOL101C 939 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 PTC4YBR125C 1182 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 MSC3YLR219W 2187 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 NUP49YGL172W 1419 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 TOS2YGR221C 1869 nt7.07□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 PPH21YDL134C 1110 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 HED1YDR014W-A 489 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 YSC83YHR017W 1158 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 GLC8YMR311C 690 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 SSU72YNL222W 621 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 PHA2YNL316C 1005 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 YNR014WYNR014W 639 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 TMA46YOR091W 1038 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 ARL3YPL051W 597 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 TGS1YPL157W 948 nt7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.8 ms