Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F1Q01094 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F1Q01094 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F1Q01094 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms