Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
AFDNP55196 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
AFDNP55196 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
AFDNP55196 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
AFDNP55196 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AFDNP55196 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AFDNP55196 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
AFDNP55196 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
AFDNP55196 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
AFDNP55196 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
AFDNP55196 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
AFDNP55196 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
AFDNP55196 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
AFDNP55196 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
AFDNP55196 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
AFDNP55196 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
AFDNP55196 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31■■■□□ 2.55
AFDNP55196 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
AFDNP55196 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AFDNP55196 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AFDNP55196 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
AFDNP55196 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
AFDNP55196 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AFDNP55196 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AFDNP55196 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
AFDNP55196 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
AFDNP55196 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
AFDNP55196 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
AFDNP55196 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AFDNP55196 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AFDNP55196 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AFDNP55196 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AFDNP55196 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
AFDNP55196 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
AFDNP55196 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
AFDNP55196 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
AFDNP55196 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
AFDNP55196 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
AFDNP55196 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
AFDNP55196 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
AFDNP55196 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
AFDNP55196 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
AFDNP55196 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
AFDNP55196 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
AFDNP55196 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
AFDNP55196 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
AFDNP55196 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
AFDNP55196 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
AFDNP55196 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
AFDNP55196 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
AFDNP55196 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AFDNP55196 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
AFDNP55196 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
AFDNP55196 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AFDNP55196 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
AFDNP55196 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AFDNP55196 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
AFDNP55196 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
AFDNP55196 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
AFDNP55196 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
AFDNP55196 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
AFDNP55196 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AFDNP55196 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AFDNP55196 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
AFDNP55196 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AFDNP55196 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
AFDNP55196 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AFDNP55196 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AFDNP55196 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
AFDNP55196 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
AFDNP55196 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
AFDNP55196 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
AFDNP55196 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
AFDNP55196 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
AFDNP55196 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
AFDNP55196 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
AFDNP55196 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
AFDNP55196 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
AFDNP55196 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
AFDNP55196 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AFDNP55196 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AFDNP55196 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AFDNP55196 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
AFDNP55196 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
AFDNP55196 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AFDNP55196 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
AFDNP55196 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
AFDNP55196 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
AFDNP55196 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
AFDNP55196 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
AFDNP55196 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AFDNP55196 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
AFDNP55196 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
AFDNP55196 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
AFDNP55196 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
AFDNP55196 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
AFDNP55196 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
AFDNP55196 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
AFDNP55196 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
AFDNP55196 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms