Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GDF10P55107 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF10P55107 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF10P55107 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF10P55107 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF10P55107 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF10P55107 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF10P55107 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF10P55107 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF10P55107 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF10P55107 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF10P55107 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF10P55107 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF10P55107 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF10P55107 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF10P55107 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF10P55107 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF10P55107 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF10P55107 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF10P55107 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF10P55107 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF10P55107 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF10P55107 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF10P55107 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF10P55107 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF10P55107 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF10P55107 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF10P55107 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF10P55107 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF10P55107 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF10P55107 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF10P55107 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF10P55107 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF10P55107 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF10P55107 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF10P55107 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF10P55107 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF10P55107 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF10P55107 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF10P55107 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF10P55107 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF10P55107 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF10P55107 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF10P55107 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF10P55107 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF10P55107 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF10P55107 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF10P55107 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF10P55107 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF10P55107 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF10P55107 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF10P55107 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF10P55107 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF10P55107 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF10P55107 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF10P55107 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF10P55107 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF10P55107 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF10P55107 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF10P55107 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF10P55107 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF10P55107 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF10P55107 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF10P55107 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF10P55107 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms