Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSEN2P49810 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSEN2P49810 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms