Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT2P35908 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT2P35908 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT2P35908 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT2P35908 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT2P35908 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT2P35908 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT2P35908 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT2P35908 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT2P35908 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT2P35908 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT2P35908 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT2P35908 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT2P35908 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT2P35908 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT2P35908 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT2P35908 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT2P35908 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT2P35908 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT2P35908 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT2P35908 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT2P35908 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT2P35908 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT2P35908 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT2P35908 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT2P35908 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT2P35908 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT2P35908 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT2P35908 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT2P35908 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT2P35908 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT2P35908 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT2P35908 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT2P35908 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT2P35908 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT2P35908 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT2P35908 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT2P35908 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT2P35908 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KRT2P35908 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT2P35908 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT2P35908 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT2P35908 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT2P35908 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT2P35908 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT2P35908 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT2P35908 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT2P35908 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT2P35908 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT2P35908 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT2P35908 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT2P35908 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT2P35908 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT2P35908 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT2P35908 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT2P35908 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT2P35908 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT2P35908 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT2P35908 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT2P35908 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT2P35908 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT2P35908 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT2P35908 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT2P35908 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT2P35908 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT2P35908 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT2P35908 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT2P35908 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT2P35908 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT2P35908 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT2P35908 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT2P35908 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT2P35908 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT2P35908 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT2P35908 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT2P35908 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT2P35908 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT2P35908 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT2P35908 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT2P35908 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT2P35908 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT2P35908 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT2P35908 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT2P35908 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT2P35908 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT2P35908 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT2P35908 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT2P35908 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT2P35908 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT2P35908 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT2P35908 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT2P35908 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT2P35908 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT2P35908 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT2P35908 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT2P35908 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT2P35908 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT2P35908 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT2P35908 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT2P35908 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms