Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA4P35212 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA4P35212 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA4P35212 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA4P35212 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA4P35212 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA4P35212 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA4P35212 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA4P35212 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA4P35212 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJA4P35212 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJA4P35212 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA4P35212 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA4P35212 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA4P35212 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA4P35212 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA4P35212 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA4P35212 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA4P35212 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA4P35212 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA4P35212 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA4P35212 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA4P35212 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA4P35212 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA4P35212 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA4P35212 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA4P35212 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA4P35212 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA4P35212 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA4P35212 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA4P35212 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA4P35212 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA4P35212 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA4P35212 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA4P35212 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA4P35212 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA4P35212 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA4P35212 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA4P35212 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA4P35212 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA4P35212 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA4P35212 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA4P35212 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA4P35212 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA4P35212 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA4P35212 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA4P35212 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA4P35212 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA4P35212 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA4P35212 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA4P35212 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA4P35212 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA4P35212 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA4P35212 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA4P35212 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA4P35212 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA4P35212 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA4P35212 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA4P35212 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA4P35212 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA4P35212 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA4P35212 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA4P35212 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA4P35212 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA4P35212 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA4P35212 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA4P35212 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA4P35212 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA4P35212 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA4P35212 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA4P35212 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA4P35212 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA4P35212 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA4P35212 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA4P35212 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA4P35212 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA4P35212 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA4P35212 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA4P35212 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA4P35212 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA4P35212 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA4P35212 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA4P35212 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA4P35212 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA4P35212 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA4P35212 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA4P35212 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA4P35212 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA4P35212 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA4P35212 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms