Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7P17544 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7P17544 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7P17544 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7P17544 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7P17544 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7P17544 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7P17544 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7P17544 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7P17544 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7P17544 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7P17544 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF7P17544 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF7P17544 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF7P17544 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF7P17544 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF7P17544 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF7P17544 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF7P17544 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF7P17544 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF7P17544 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF7P17544 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF7P17544 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF7P17544 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF7P17544 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF7P17544 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF7P17544 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF7P17544 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF7P17544 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF7P17544 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF7P17544 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF7P17544 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF7P17544 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF7P17544 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF7P17544 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF7P17544 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF7P17544 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF7P17544 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF7P17544 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF7P17544 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF7P17544 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF7P17544 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF7P17544 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF7P17544 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF7P17544 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF7P17544 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF7P17544 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF7P17544 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF7P17544 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF7P17544 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF7P17544 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF7P17544 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF7P17544 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF7P17544 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF7P17544 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF7P17544 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF7P17544 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF7P17544 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF7P17544 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF7P17544 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF7P17544 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF7P17544 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF7P17544 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF7P17544 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF7P17544 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF7P17544 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF7P17544 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF7P17544 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF7P17544 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF7P17544 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF7P17544 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF7P17544 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF7P17544 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF7P17544 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF7P17544 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF7P17544 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATF7P17544 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATF7P17544 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATF7P17544 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms