Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPEP16870 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPEP16870 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPEP16870 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPEP16870 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPEP16870 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPEP16870 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPEP16870 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPEP16870 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CPEP16870 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPEP16870 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPEP16870 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPEP16870 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPEP16870 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPEP16870 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPEP16870 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPEP16870 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPEP16870 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPEP16870 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPEP16870 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CPEP16870 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPEP16870 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPEP16870 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPEP16870 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPEP16870 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPEP16870 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPEP16870 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPEP16870 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPEP16870 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPEP16870 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPEP16870 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPEP16870 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CPEP16870 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPEP16870 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CPEP16870 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CPEP16870 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPEP16870 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPEP16870 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPEP16870 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPEP16870 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPEP16870 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEP16870 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEP16870 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPEP16870 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms