Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VEGFAP15692 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VEGFAP15692 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VEGFAP15692 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
VEGFAP15692 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms