Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI3P10071 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI3P10071 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI3P10071 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI3P10071 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI3P10071 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI3P10071 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI3P10071 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI3P10071 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI3P10071 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI3P10071 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI3P10071 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI3P10071 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI3P10071 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI3P10071 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI3P10071 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI3P10071 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI3P10071 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI3P10071 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI3P10071 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI3P10071 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI3P10071 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI3P10071 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI3P10071 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI3P10071 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI3P10071 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI3P10071 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI3P10071 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI3P10071 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI3P10071 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI3P10071 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI3P10071 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI3P10071 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI3P10071 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI3P10071 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI3P10071 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI3P10071 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI3P10071 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI3P10071 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI3P10071 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI3P10071 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI3P10071 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI3P10071 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI3P10071 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI3P10071 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI3P10071 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI3P10071 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI3P10071 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI3P10071 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI3P10071 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI3P10071 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI3P10071 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI3P10071 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI3P10071 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GLI3P10071 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GLI3P10071 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GLI3P10071 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GLI3P10071 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GLI3P10071 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GLI3P10071 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GLI3P10071 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GLI3P10071 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GLI3P10071 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GLI3P10071 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GLI3P10071 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
GLI3P10071 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GLI3P10071 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GLI3P10071 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GLI3P10071 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GLI3P10071 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GLI3P10071 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GLI3P10071 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GLI3P10071 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GLI3P10071 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GLI3P10071 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GLI3P10071 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GLI3P10071 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
GLI3P10071 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GLI3P10071 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GLI3P10071 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
GLI3P10071 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GLI3P10071 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
GLI3P10071 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GLI3P10071 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GLI3P10071 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GLI3P10071 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GLI3P10071 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GLI3P10071 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLI3P10071 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLI3P10071 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLI3P10071 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLI3P10071 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLI3P10071 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLI3P10071 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GLI3P10071 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GLI3P10071 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GLI3P10071 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GLI3P10071 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GLI3P10071 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GLI3P10071 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms