Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE6O95741 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPNE6O95741 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms