Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE3O75131 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE3O75131 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms