Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
KDM6AO15550 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM6AO15550 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM6AO15550 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM6AO15550 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.7 ms