Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM23A6NLE4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM23A6NLE4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM23A6NLE4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms